厦门大学医院1921年由爱国华侨陈嘉庚先生亲手创办，历史上曾作为“厦门医学院厦大医院”对外开展医疗工作，在闽南金三角及东南亚一带享有较高声誉。
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厦门大学附属厦门眼科中心是一所集医疗、教学、科研、防盲为一体的国家三级甲等眼科医院, 成立于1997年11月8日。2006年6月7日正式成为厦门大学附属医院。
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厦门大学附属中山医院创建于1928年，由爱国华侨和地方知名人士为弘扬中山先生“天下为公，造福社会”的精神捐资兴建而成，时任厦门大学校长、医学专家林文庆博士出任首任院长。1981年，中山医院作为厦门经济特区重点建设配套工程迁址重建，1988年重新开诊。目前，医院已发展成为一所集医疗、教学、科研、预防保健于一体的三级甲等综合性医院和国家重点大学附属医院。
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厦门大学附属第一医院创办于1937年，前身为福建省立医院，经过70余年发展，现已形成拥有四所分院、两家护理院、九个社区医疗服务中心的医疗集群，是集医疗、教学、科研、预防、康复为一体的闽西南规模最大的三甲综合医院。
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厦门大学图书馆设有1个总馆，5个分馆，拥有馆舍面积6.2万平方米，阅览座位6000个；在校本部，除总馆外，另设置有法学分馆、文史分馆、经济与管理分馆三个专业分馆；此外在厦大漳州校区和东部学生公寓还设有分馆。
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